MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 3323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	TG	3	6	149	154	0 %	50 %	50 %	0 %	209418038
2	NC_011355	CGG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418038
3	NC_011355	CGC	2	6	189	194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
4	NC_011355	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418038
5	NC_011355	CCA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418038
6	NC_011355	GCCTAC	2	12	308	319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418038
7	NC_011355	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418038
8	NC_011355	GCC	2	6	347	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
9	NC_011355	CCT	2	6	377	382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209418038
10	NC_011355	CA	4	8	498	505	50 %	0 %	0 %	50 %	209418038
11	NC_011355	TAC	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418038
12	NC_011355	GCG	2	6	563	568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418038
13	NC_011355	CGC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
14	NC_011355	TCG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418038
15	NC_011355	CCGCAG	2	12	695	706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418038
16	NC_011355	GC	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	209418038
17	NC_011355	TGCT	2	8	809	816	0 %	50 %	25 %	25 %	209418038
18	NC_011355	AAAC	2	8	913	920	75 %	0 %	0 %	25 %	209418038
19	NC_011355	GCCG	2	8	955	962	0 %	0 %	50 %	50 %	209418038
20	NC_011355	CGC	2	6	963	968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
21	NC_011355	CCA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418038
22	NC_011355	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
23	NC_011355	TGC	6	18	1002	1019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418038
24	NC_011355	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
25	NC_011355	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	209418038
26	NC_011355	GCG	2	6	1078	1083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418038
27	NC_011355	CAG	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418038
28	NC_011355	AGC	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418038
29	NC_011355	TGC	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418038
30	NC_011355	GATC	2	8	1174	1181	25 %	25 %	25 %	25 %	209418038
31	NC_011355	TGC	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418038
32	NC_011355	CGC	2	6	1222	1227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418038
33	NC_011355	GCC	2	6	1260	1265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418039
34	NC_011355	TGG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418039
35	NC_011355	TTAC	2	8	1710	1717	25 %	50 %	0 %	25 %	209418040
36	NC_011355	CCT	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209418040
37	NC_011355	AGC	2	6	1836	1841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418040
38	NC_011355	CAA	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418040
39	NC_011355	GAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209418040
40	NC_011355	TCAC	2	8	1958	1965	25 %	25 %	0 %	50 %	209418040
41	NC_011355	ACA	2	6	1970	1975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418040
42	NC_011355	TGG	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418040
43	NC_011355	GCC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418040
44	NC_011355	GC	3	6	2031	2036	0 %	0 %	50 %	50 %	209418040
45	NC_011355	CGC	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418040
46	NC_011355	CTCG	2	8	2076	2083	0 %	25 %	25 %	50 %	209418040
47	NC_011355	CGA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418040
48	NC_011355	CG	3	6	2135	2140	0 %	0 %	50 %	50 %	209418040
49	NC_011355	CAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418040
50	NC_011355	GAC	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418040
51	NC_011355	ATC	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418040
52	NC_011355	CAC	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418040
53	NC_011355	TCCT	2	8	2309	2316	0 %	50 %	0 %	50 %	209418041
54	NC_011355	CCT	2	6	2400	2405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209418041
55	NC_011355	CGG	2	6	2412	2417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418041
56	NC_011355	GC	3	6	2436	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	209418041
57	NC_011355	CCA	2	6	2444	2449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418041
58	NC_011355	GAT	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209418041
59	NC_011355	CCG	2	6	2652	2657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418041
60	NC_011355	GGCC	2	8	2681	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	209418041
61	NC_011355	TGCG	2	8	2694	2701	0 %	25 %	50 %	25 %	209418041
62	NC_011355	GGC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418041
63	NC_011355	CAG	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418041
64	NC_011355	GGCTG	2	10	2810	2819	0 %	20 %	60 %	20 %	209418041
65	NC_011355	GCG	2	6	2898	2903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418041
66	NC_011355	GAC	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418042
67	NC_011355	ATT	2	6	3075	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209418042
68	NC_011355	TTC	3	9	3208	3216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209418042
69	NC_011355	TCG	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418042
70	NC_011355	ACA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418042
71	NC_011355	CA	3	6	3386	3391	50 %	0 %	0 %	50 %	209418042
72	NC_011355	GCC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418042
73	NC_011355	GAA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209418042
74	NC_011355	CGCCAG	2	12	3471	3482	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418042
75	NC_011355	GACG	2	8	3548	3555	25 %	0 %	50 %	25 %	209418042
76	NC_011355	AAC	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418042
77	NC_011355	CGGA	2	8	3585	3592	25 %	0 %	50 %	25 %	209418042
78	NC_011355	GTC	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418042
79	NC_011355	CG	3	6	3728	3733	0 %	0 %	50 %	50 %	209418042
80	NC_011355	GCG	2	6	3754	3759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418042
81	NC_011355	CCAGC	2	10	3854	3863	20 %	0 %	20 %	60 %	209418042
82	NC_011355	GTC	2	6	3864	3869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418042
83	NC_011355	GTGG	2	8	5320	5327	0 %	25 %	75 %	0 %	209418043
84	NC_011355	GTC	2	6	5352	5357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418043
85	NC_011355	TGA	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209418043
86	NC_011355	TGG	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418043
87	NC_011355	GGCC	2	8	5379	5386	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
88	NC_011355	TGG	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418043
89	NC_011355	TGG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418043
90	NC_011355	TGC	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418043
91	NC_011355	GCA	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418043
92	NC_011355	CGC	2	6	5586	5591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418043
93	NC_011355	GGC	2	6	5631	5636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418043
94	NC_011355	CGG	2	6	5643	5648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418043
95	NC_011355	ATGG	2	8	5656	5663	25 %	25 %	50 %	0 %	209418043
96	NC_011355	CGG	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418043
97	NC_011355	GCGT	2	8	5730	5737	0 %	25 %	50 %	25 %	209418043
98	NC_011355	TGG	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418043
99	NC_011355	GTT	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209418043
100	NC_011355	GGT	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418043
101	NC_011355	ATGGGA	2	12	5899	5910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	209418043
102	NC_011355	CCTGG	2	10	5953	5962	0 %	20 %	40 %	40 %	209418043
103	NC_011355	CACC	2	8	5982	5989	25 %	0 %	0 %	75 %	209418043
104	NC_011355	CAC	3	9	5992	6000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418043
105	NC_011355	CCGG	2	8	6027	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
106	NC_011355	CGG	3	9	6039	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418043
107	NC_011355	GC	3	6	6058	6063	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
108	NC_011355	TG	3	6	6105	6110	0 %	50 %	50 %	0 %	209418043
109	NC_011355	CAA	2	6	6319	6324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418043
110	NC_011355	GCG	2	6	6402	6407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418044
111	NC_011355	GCC	2	6	6456	6461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418044
112	NC_011355	GACC	2	8	6481	6488	25 %	0 %	25 %	50 %	209418044
113	NC_011355	AGGC	2	8	6500	6507	25 %	0 %	50 %	25 %	209418044
114	NC_011355	CGG	2	6	6689	6694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418044
115	NC_011355	AGC	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418044
116	NC_011355	CGG	2	6	6918	6923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418044
117	NC_011355	GAC	2	6	7377	7382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418045
118	NC_011355	ATC	2	6	7449	7454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418045
119	NC_011355	GGT	2	6	7511	7516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418045
120	NC_011355	CGCT	2	8	7617	7624	0 %	25 %	25 %	50 %	209418045
121	NC_011355	CCCGGC	2	12	7668	7679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418045
122	NC_011355	GCAC	2	8	7703	7710	25 %	0 %	25 %	50 %	209418045
123	NC_011355	GAGC	2	8	7722	7729	25 %	0 %	50 %	25 %	209418045
124	NC_011355	CGA	2	6	7767	7772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418046
125	NC_011355	CTG	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418046
126	NC_011355	GCAC	2	8	7830	7837	25 %	0 %	25 %	50 %	209418046
127	NC_011355	AGCGCC	2	12	7916	7927	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418046
128	NC_011355	TGG	2	6	7928	7933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418046
129	NC_011355	GCA	2	6	7937	7942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418046
130	NC_011355	GCC	2	6	7952	7957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418046
131	NC_011355	CCTA	2	8	7970	7977	25 %	25 %	0 %	50 %	209418046
132	NC_011355	CCG	2	6	7985	7990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418046
133	NC_011355	CCTC	2	8	8003	8010	0 %	25 %	0 %	75 %	209418046
134	NC_011355	GC	3	6	8093	8098	0 %	0 %	50 %	50 %	209418046
135	NC_011355	CGG	2	6	8121	8126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418046
136	NC_011355	GCG	2	6	8249	8254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418047
137	NC_011355	GTT	2	6	8301	8306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209418047
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139	NC_011355	ACCG	2	8	8364	8371	25 %	0 %	25 %	50 %	209418047
140	NC_011355	TTGT	2	8	8391	8398	0 %	75 %	25 %	0 %	209418047
141	NC_011355	GCC	2	6	8432	8437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418047
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149	NC_011355	AGG	2	6	8761	8766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209418047
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252	NC_011355	CCG	2	6	19302	19307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418052
253	NC_011355	CGC	2	6	19334	19339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418052
254	NC_011355	ACCGTC	2	12	19353	19364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209418052
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257	NC_011355	AAG	2	6	19571	19576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209418053
258	NC_011355	GGA	2	6	19593	19598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209418053
259	NC_011355	AGC	2	6	19605	19610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418053
260	NC_011355	CAG	2	6	19636	19641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418053
261	NC_011355	CGT	2	6	19685	19690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418053
262	NC_011355	CAC	2	6	19742	19747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418053
263	NC_011355	CAC	2	6	19761	19766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418053
264	NC_011355	TCG	3	9	19789	19797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418053
265	NC_011355	ACT	2	6	19834	19839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418053
266	NC_011355	GCT	2	6	20024	20029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418053
267	NC_011355	GTG	2	6	20039	20044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418053
268	NC_011355	TTGA	2	8	20091	20098	25 %	50 %	25 %	0 %	209418053
269	NC_011355	CAC	2	6	20100	20105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418053
270	NC_011355	ACGC	2	8	20153	20160	25 %	0 %	25 %	50 %	209418053
271	NC_011355	CGC	2	6	20228	20233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418053
272	NC_011355	CAGT	2	8	20246	20253	25 %	25 %	25 %	25 %	209418053
273	NC_011355	CGGCC	2	10	20367	20376	0 %	0 %	40 %	60 %	209418053
274	NC_011355	AGC	3	9	20392	20400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418053
275	NC_011355	CGA	2	6	20459	20464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418053
276	NC_011355	CCA	2	6	20490	20495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418053
277	NC_011355	CG	3	6	20497	20502	0 %	0 %	50 %	50 %	209418053
278	NC_011355	CGA	2	6	20645	20650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418054
279	NC_011355	ACC	2	6	20683	20688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418054
280	NC_011355	ACG	2	6	20689	20694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209418054
281	NC_011355	CGCC	2	8	20732	20739	0 %	0 %	25 %	75 %	209418054
282	NC_011355	GGCT	2	8	20751	20758	0 %	25 %	50 %	25 %	209418054
283	NC_011355	CGGCC	2	10	20784	20793	0 %	0 %	40 %	60 %	209418054
284	NC_011355	GACC	2	8	20804	20811	25 %	0 %	25 %	50 %	209418054
285	NC_011355	TGG	2	6	21206	21211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418055
286	NC_011355	CGG	2	6	21231	21236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418055
287	NC_011355	GCT	2	6	21264	21269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418055
288	NC_011355	TGG	2	6	21371	21376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209418055
289	NC_011355	GCG	2	6	21413	21418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418055
290	NC_011355	AGCA	2	8	21419	21426	50 %	0 %	25 %	25 %	209418055
291	NC_011355	TGC	2	6	21437	21442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418055
292	NC_011355	CG	3	6	21498	21503	0 %	0 %	50 %	50 %	209418055
293	NC_011355	GCC	3	9	21546	21554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418055
294	NC_011355	CAC	2	6	21569	21574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418055
295	NC_011355	TGC	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418055
296	NC_011355	CGCGGC	2	12	21636	21647	0 %	0 %	50 %	50 %	209418055
297	NC_011355	TTC	2	6	21723	21728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209418055
298	NC_011355	CGT	2	6	21837	21842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209418055
299	NC_011355	GCCG	2	8	21930	21937	0 %	0 %	50 %	50 %	209418055
300	NC_011355	GCAC	2	8	21955	21962	25 %	0 %	25 %	50 %	209418055
301	NC_011355	GCG	2	6	21994	21999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418055
302	NC_011355	GCG	2	6	22015	22020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418055
303	NC_011355	CGG	2	6	22040	22045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418055
304	NC_011355	CCG	2	6	22046	22051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209418055
305	NC_011355	AGA	2	6	22052	22057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209418055
306	NC_011355	ACGCCG	2	12	22061	22072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209418055
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379	NC_011355	ATC	2	6	24980	24985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209418057
380	NC_011355	GGC	2	6	25024	25029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209418057
381	NC_011355	ACC	2	6	25061	25066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418057
382	NC_011355	ACC	3	9	25121	25129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418057
383	NC_011355	CAA	2	6	25144	25149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418057
384	NC_011355	AACA	2	8	25161	25168	75 %	0 %	0 %	25 %	209418057
385	NC_011355	CAAAT	2	10	25169	25178	60 %	20 %	0 %	20 %	209418057
386	NC_011355	ACC	2	6	25232	25237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209418057
387	NC_011355	CAA	2	6	25245	25250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209418057
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389	NC_011355	CG	3	6	25370	25375	0 %	0 %	50 %	50 %	209418057
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